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李慧琦教授研究团队

Prof. Huiqi Li's Research Group

VesselTrackCorrection视网膜图像血管跟踪修正软件

发布于 2021-11-29 21:00:00 CST

 

软件简介

功能

VesselTrackCorrection软件是一款手动修正血管跟踪的软件,是基于视网膜图像血管跟踪的方法及其相关理论,采用MATLAB软件编程开发。主要功能是修正视网膜图像中血管跟踪错误的地方,可以较为实时的向用户展示视网膜图像血管跟踪的情况,并且最终保存正确的视网膜图像血管跟踪结果。

VesselTrackCorrection 软件在选择任意一张眼底图后,将实现以下功能:

• 血管跟踪:可以得到视网膜图像血管跟踪结果。

• 选择中断点:可以在选定的血管上进行血管跟踪点的选定。

• 重新跟踪:在选择中断点后删除中断点之后的血管跟踪点。

• 选择错误类型:根据提示选择需要的错误修改类型,进行视网膜图像血管修正。

• 检查并保存:将修改好的视网膜图像血管跟踪结果进行保存。

综上所述展示了该系统的整体功能,从而可以看出该系统具有较为完善的操作功能,可以通过该系统得到视网膜图像血管跟踪的正确结果。该系统的具体操作流程将详细地说明该系统中每个按钮的具体作用以及可以得到的结果,从而可以更加详细地了解和学习该系统的操作流程。

性能

• 输入图像类型:本软件输入图像的类型可以为“.jpg”、“.png”以及“.bmp”,输入视网膜图像尺寸以宽为1018像素,等比例放缩。

• 处理时间:根据输入图像中血管根数不同,本软件完成测量一张眼底图所需要的时间也是有所差别的。测量时间主要与修改血管所需要的时间有关。

• 灵活性和可靠性:本软件可以输入任何尺寸的眼底图,并且在手动修正结束后会出现相应的完成操作的提示框。

运行环境

VesselTrackCorrection 软件主要在MATLAB 2016及以上版本上完成测试工作。在一般装有Window 10 64位的操作系统上均可完成该软件的运行。

 

使用说明

(1)双击“MyAppInstaller_mcr.exe”进行安装软件,安装路径应该与所带的文件夹在一个根目录下,安装好之后,在application文件夹中将“VesselTrackCorrection.exe”放到与新建的文件夹同一个根目录下,双击“VesselTrackCorrection.exe”弹出软件主界面,如图1所示。

图1 软件初始化界面

界面的左上角是“放大镜”、“缩小镜”以及“手”的图标,右下角是四个文本框,分别代表了“第几根血管”-中断或者目前所要修改的血管的标号、“从第几对点开始”-代表了中断所在的位置以及要修改的位置、“分支关系”-代表了目前所修改血管的分支情况、“第几行”-代表了目前所修改血管的段数。

(2)点击“选择视网膜图像按钮”:会弹出一个文件夹用来选择视网膜图像,点击确定,视网膜图像将在左坐标轴所展示,如图2(a)和2(b)所示。

图2(a) 点击选择视网膜图像

图2(b) 成功选择视网图像

(3)点击“血管跟踪”按钮:启动血管跟踪程序,血管跟踪图将右坐标轴所展示,如图3所示。

图3 血管跟踪结果

右坐标轴中两个黑色圆圈分别代表了距离视盘2倍半径的距离和3倍半径的距离,并且血管上A1-A4代表四大主动脉,V1-V4代表四大主静脉,血管上的数字是该血管是标号。

(4)点击“选择中断点”按钮:在点击之前,先把想要中断的地方放大,确定想要修改血管是第几根,如下界面所示输入想要中断第几根血管,点击确定;然后可以在想要中断的血管边界点顺时针点击两下,将选中所要中断的位置,如图4(a)和4(b)所示。

图4(a) 输入想要中断第几根血管

图4(b) 选择中断点坐标

(5)点击“重新跟踪”按钮:可以将中断之后的血管边界点全部擦除,并且其他没有中断的血管跟踪不变,如图5所示。

图5 重新跟踪

(6)点击“选择错误类型”按钮:将会弹出一个选择窗口,如图6所示。

图6 选择错误类型

可以选择修改血管的颜色以及修改的方式,注意这里的点击顺序是顺时针标注血管的边界,并且点击两下-先点击右边界再点击左边界。选择“1-边界点”可以一个一个点进行标注;选择“2-连续点”只需要点击两下就可以跟踪血管余下的边界;点击“3-分支点”是遇到分支的情况下进行选择的。

(7)点击“检查与保存”按钮:可以将修改好的图片以及对应的数据保存下来,如图7所示。

图7 修改后的血管跟踪

(8)修改完成后会将修改后的结果以mat的形式保存newmat文件夹中,并且在detect文件夹中会保存最终修改的视网膜图像血管跟踪图,如图8(a)和8(b)所示。

图8(a) 修改好后新mat的保存

图8(b) 修改好后血管跟踪结果图

 

总结

VesselTrackCorrection 软件可以修正跟踪错误的视网膜图像血管,并且可以根据血管的结构特点选择不同的修改类型进行视网膜图像血管的修改,最终得到正确的视网膜图像血管跟踪结果,为后续视网膜图像血管分析提供帮助。

本软件是针对修改视网膜图像血管跟踪所设计的,其功能较为完备、简单的操作,可以更方便于医生和相关研究人员的使用。

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网页发布于 2021-08-06